Protein–RNA interactions for Protein: A2CFD5

Btbd35f28, BTB domain-containing 35, family member 28, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Btbd35f28A2CFD5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Btbd35f28A2CFD5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms