Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQ45

6430628N08Rik, MCG1049118, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430628N08RikA0A0U1RQ45 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms