Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Serpinb1-ps1-201ENSMUST00000118548 586 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm13545-201ENSMUST00000119044 482 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm13788-201ENSMUST00000120767 601 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm12321-201ENSMUST00000121485 804 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm12239-201ENSMUST00000134285 500 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm14505-201ENSMUST00000145383 831 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Vmn1r167-201ENSMUST00000164527 948 ntAPPRIS P1 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm22166-201ENSMUST00000178419 121 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm23288-201ENSMUST00000179213 121 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Rhox4a2-201ENSMUST00000179915 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm5272-201ENSMUST00000182730 982 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm3605-201ENSMUST00000185858 440 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm28763-201ENSMUST00000188870 166 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm29579-201ENSMUST00000190820 166 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm43203-201ENSMUST00000200130 558 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm4742-201ENSMUST00000200261 771 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm44785-202ENSMUST00000208294 932 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm44861-201ENSMUST00000208325 1220 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm18903-201ENSMUST00000215343 480 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 AC163661.1-201ENSMUST00000216546 910 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm2089-201ENSMUST00000218294 479 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 4930563J15Rik-202ENSMUST00000219752 560 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Tbc1d7-204ENSMUST00000220787 892 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gsta4-201ENSMUST00000034903 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Olfr124-201ENSMUST00000053599 1122 ntAPPRIS P1 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Npm2-201ENSMUST00000062629 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Rhox4e-201ENSMUST00000089075 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm38300-201ENSMUST00000194245 1870 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Myo16-202ENSMUST00000207204 6719 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Plec-207ENSMUST00000076442 15439 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Plb1-205ENSMUST00000202201 3539 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm10727-201ENSMUST00000197107 1602 ntBASIC8.65□□□□□ -1.03
Rpusd2Q149F1 Erg-202ENSMUST00000113846 3249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Rpusd2Q149F1 Grik2-205ENSMUST00000218598 3245 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
Rpusd2Q149F1 Ccdc187-203ENSMUST00000227200 9528 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.65□□□□□ -1.03
Rpusd2Q149F1 Gm21292-201ENSMUST00000171947 1563 ntAPPRIS P1 BASIC8.65□□□□□ -1.03
Rpusd2Q149F1 4921524L21Rik-201ENSMUST00000044829 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpusd2Q149F1 Gm39041-201ENSMUST00000205557 3902 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpusd2Q149F1 Gm26606-201ENSMUST00000181292 2439 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpusd2Q149F1 Tex14-201ENSMUST00000060835 4763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpusd2Q149F1 Skp2-202ENSMUST00000110585 6185 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpusd2Q149F1 Gm11733-201ENSMUST00000092394 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpusd2Q149F1 Gm44288-201ENSMUST00000205061 2795 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpusd2Q149F1 Mettl21e-201ENSMUST00000054801 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpusd2Q149F1 Ighd-202ENSMUST00000194162 1806 ntAPPRIS P5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpusd2Q149F1 AC158596.1-201ENSMUST00000217315 2265 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpusd2Q149F1 Csde1-216ENSMUST00000199571 3123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpusd2Q149F1 Gbp11-202ENSMUST00000171587 1329 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpusd2Q149F1 Tmcc1-203ENSMUST00000172510 2612 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpusd2Q149F1 Olfr727-202ENSMUST00000215317 2616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpusd2Q149F1 Zfp386-204ENSMUST00000183125 4779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpusd2Q149F1 Gm14995-201ENSMUST00000117135 391 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpusd2Q149F1 Gm13245-201ENSMUST00000119646 260 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpusd2Q149F1 Gm568-201ENSMUST00000135777 506 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpusd2Q149F1 Gm22604-201ENSMUST00000157604 311 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpusd2Q149F1 Gm15946-201ENSMUST00000160654 423 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpusd2Q149F1 Smim9-203ENSMUST00000165080 414 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpusd2Q149F1 Gm17223-201ENSMUST00000171413 481 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpusd2Q149F1 Gm17786-201ENSMUST00000182000 427 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpusd2Q149F1 Ranbp2-ps10-201ENSMUST00000185097 385 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpusd2Q149F1 Gm8004-201ENSMUST00000187782 617 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpusd2Q149F1 Gm37341-201ENSMUST00000194680 371 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpusd2Q149F1 Traf1-209ENSMUST00000201690 386 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpusd2Q149F1 Olfr717-ps1-201ENSMUST00000205589 556 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpusd2Q149F1 Gm9604-201ENSMUST00000211175 433 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpusd2Q149F1 Gm6581-201ENSMUST00000214545 260 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpusd2Q149F1 Gm40271-201ENSMUST00000221752 422 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpusd2Q149F1 AC113031.5-201ENSMUST00000227116 606 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpusd2Q149F1 Gm12582-201ENSMUST00000030555 697 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpusd2Q149F1 Olfr535-201ENSMUST00000074897 991 ntAPPRIS P1 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpusd2Q149F1 F5-201ENSMUST00000086040 7430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpusd2Q149F1 Kcnb2-202ENSMUST00000175681 3963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpusd2Q149F1 Afap1l2-201ENSMUST00000111584 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpusd2Q149F1 Gm37876-201ENSMUST00000194490 1591 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpusd2Q149F1 Gm35315-202ENSMUST00000210052 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpusd2Q149F1 Macrod2os1-201ENSMUST00000151538 3131 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpusd2Q149F1 Gm37570-201ENSMUST00000195411 3106 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpusd2Q149F1 Gm38661-201ENSMUST00000216555 5814 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpusd2Q149F1 Gm44854-201ENSMUST00000205493 2340 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpusd2Q149F1 Csde1-211ENSMUST00000198180 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpusd2Q149F1 Gm2762-207ENSMUST00000202739 2665 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpusd2Q149F1 Vmn2r-ps94-201ENSMUST00000116665 1456 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpusd2Q149F1 Lyg2-201ENSMUST00000078307 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpusd2Q149F1 Ptk6-201ENSMUST00000016511 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpusd2Q149F1 Dbhos-201ENSMUST00000150024 4020 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpusd2Q149F1 Gabra1-205ENSMUST00000205546 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpusd2Q149F1 Myo1e-201ENSMUST00000034745 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Rpusd2Q149F1 Gm44769-201ENSMUST00000206120 2809 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Rpusd2Q149F1 Sorbs2-215ENSMUST00000135336 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Rpusd2Q149F1 Rnf213-203ENSMUST00000172235 2422 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Rpusd2Q149F1 Nr1h5-202ENSMUST00000196135 1344 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Rpusd2Q149F1 Gm8853-201ENSMUST00000198366 1344 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Rpusd2Q149F1 5430401H09Rik-202ENSMUST00000218836 2620 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Rpusd2Q149F1 Parp6-202ENSMUST00000050483 2631 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Rpusd2Q149F1 Prpf18-201ENSMUST00000035721 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Rpusd2Q149F1 Trbv1-201ENSMUST00000103262 417 ntAPPRIS P1 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Rpusd2Q149F1 Gm14631-201ENSMUST00000119067 594 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Rpusd2Q149F1 Gm12944-201ENSMUST00000119262 463 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Rpusd2Q149F1 Gm12322-201ENSMUST00000121605 389 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Rpusd2Q149F1 Gm12152-201ENSMUST00000122465 684 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms