Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm26731-201ENSMUST00000180683 543 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 5033404E19Rik-201ENSMUST00000192616 630 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Gm35648-201ENSMUST00000202304 475 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Gm44604-201ENSMUST00000205475 496 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Gm44539-201ENSMUST00000206010 238 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 4930591E09Rik-201ENSMUST00000215643 480 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Mir449a-201ENSMUST00000083641 91 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Slfn5-201ENSMUST00000067443 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Yme1l1-201ENSMUST00000028117 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Olfr401-202ENSMUST00000213754 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Shprh-202ENSMUST00000054814 7225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Lars-201ENSMUST00000097590 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Olfr1504-202ENSMUST00000209192 1514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Mkks-201ENSMUST00000028730 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Gm12336-201ENSMUST00000125962 322 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Gm14582-201ENSMUST00000141697 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Gm5795-202ENSMUST00000166275 612 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Gm8279-203ENSMUST00000170040 612 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Gm10413-202ENSMUST00000177913 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Gm9602-202ENSMUST00000177973 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Gm10338-202ENSMUST00000178623 612 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Gm3012-202ENSMUST00000179486 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Gm3696-202ENSMUST00000179898 612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Gm7435-201ENSMUST00000214039 486 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 C130073F10Rik-201ENSMUST00000051043 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Gm23795-201ENSMUST00000084006 137 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Gm94-201ENSMUST00000096570 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 BC065397-203ENSMUST00000134066 3201 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Zfp507-201ENSMUST00000061586 6693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Zscan4e-202ENSMUST00000210521 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Gm13089-201ENSMUST00000073532 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Ikbkg-206ENSMUST00000114130 6736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Ktn1-202ENSMUST00000185343 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Ktn1-205ENSMUST00000186627 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 D030045P18Rik-202ENSMUST00000213571 2370 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Kmo-201ENSMUST00000040250 2695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 4933416E14Rik-201ENSMUST00000130841 491 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Gm20545-201ENSMUST00000174739 210 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Gm38291-201ENSMUST00000193671 259 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Gm32051-201ENSMUST00000196818 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Gm23011-202ENSMUST00000197855 275 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Gm45525-201ENSMUST00000210800 389 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Gm5457-201ENSMUST00000022260 333 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 AC154846.2-201ENSMUST00000228805 424 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Gm7887-201ENSMUST00000056948 537 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Mir342-201ENSMUST00000083502 99 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 H2-M9-201ENSMUST00000087165 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 1700001G01Rik-201ENSMUST00000125117 1562 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Cd84-203ENSMUST00000135386 3434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Gpr65-201ENSMUST00000075072 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Dennd6a-203ENSMUST00000224111 2692 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Vmn1r36-204ENSMUST00000226829 1923 ntAPPRIS P2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Rnd3-201ENSMUST00000017288 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Vmn2r-ps133-201ENSMUST00000176979 2569 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Olfr744-202ENSMUST00000213668 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Gm4787-201ENSMUST00000062182 2474 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Epb41l2-219ENSMUST00000220290 4345 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Stx5a-215ENSMUST00000176570 563 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 D530049I02Rik-201ENSMUST00000186582 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Gm18800-202ENSMUST00000188688 1105 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Gm3148-201ENSMUST00000203594 612 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Gm6009-201ENSMUST00000210848 280 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 AC162467.1-201ENSMUST00000220254 621 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 AC163721.1-201ENSMUST00000222669 394 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Pik3c2g-201ENSMUST00000032353 1206 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Clrn3-201ENSMUST00000053716 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Ogt-202ENSMUST00000119299 3840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Pcdhb13-201ENSMUST00000056915 3710 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Zfp729a-201ENSMUST00000012314 9455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Rabgap1-202ENSMUST00000066055 4247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Slc17a6-201ENSMUST00000032710 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Atp13a5-201ENSMUST00000075806 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 G530011O06Rik-201ENSMUST00000154810 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Scn3a-201ENSMUST00000066432 9560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Gm12317-201ENSMUST00000122307 319 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Trav6-5-202ENSMUST00000183488 335 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Gm27543-201ENSMUST00000183562 177 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Gm4874-201ENSMUST00000203589 691 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Gm44048-201ENSMUST00000204531 361 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Akt3-203ENSMUST00000111160 4735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Fam210a-201ENSMUST00000042852 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Hsf3-204ENSMUST00000164693 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Cnot4-201ENSMUST00000044163 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Gm45562-201ENSMUST00000210015 1537 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 B130034C11Rik-201ENSMUST00000175717 1401 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Tmem45a2-203ENSMUST00000227043 1447 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Zzz3-210ENSMUST00000200570 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Usp54-202ENSMUST00000035340 6495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Abcc2-202ENSMUST00000099413 1926 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 BC080695-201ENSMUST00000105765 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Dnajc19-ps-201ENSMUST00000120890 351 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Gm7309-201ENSMUST00000121670 581 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Vmn1r9-201ENSMUST00000171186 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Pantr1-203ENSMUST00000176154 514 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Gm8669-201ENSMUST00000183839 945 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Gm29594-201ENSMUST00000191181 398 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Ralyl-205ENSMUST00000192209 662 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 CT033781.1-201ENSMUST00000223128 454 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Sprr2d-201ENSMUST00000047477 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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