Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Gm7925-201ENSMUST00000166690 401 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm17074-201ENSMUST00000167284 556 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 S100a10-203ENSMUST00000170612 477 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm13698-201ENSMUST00000178325 732 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm13694-202ENSMUST00000178655 732 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm13696-201ENSMUST00000179311 732 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm13693-202ENSMUST00000179448 732 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm13695-202ENSMUST00000179504 732 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm13697-202ENSMUST00000179552 732 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm25873-201ENSMUST00000180317 107 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Pea15b-201ENSMUST00000182806 387 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm27458-201ENSMUST00000185108 121 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm29069-201ENSMUST00000185857 675 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm29242-201ENSMUST00000186570 457 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 1700027H10Rik-201ENSMUST00000186818 584 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 1700021A07Rik-202ENSMUST00000187763 485 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm19029-201ENSMUST00000189923 564 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm29475-201ENSMUST00000190767 312 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm37881-201ENSMUST00000193001 421 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm44481-201ENSMUST00000197288 84 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm7166-201ENSMUST00000199715 303 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm44339-201ENSMUST00000200598 84 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm45868-201ENSMUST00000210247 473 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm45402-201ENSMUST00000211796 223 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gpx4-ps2-202ENSMUST00000217344 782 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 AC134528.1-201ENSMUST00000219156 387 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Sbp-201ENSMUST00000024940 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm4779-201ENSMUST00000056225 672 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm10088-201ENSMUST00000074116 423 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Bmf-201ENSMUST00000090219 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Pdgfrb-202ENSMUST00000115274 5423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm16434-201ENSMUST00000100888 2066 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm6676-201ENSMUST00000166493 2066 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Olfr1512-202ENSMUST00000214980 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Ndrg1-201ENSMUST00000005256 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Dleu2-207ENSMUST00000182756 3530 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Fbxo11-201ENSMUST00000005504 4019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 A830019P07Rik-201ENSMUST00000178904 1777 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Rab23-202ENSMUST00000115174 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gpr83-202ENSMUST00000115624 2937 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Tro-207ENSMUST00000163969 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Baiap3-204ENSMUST00000182435 3758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Plag1-201ENSMUST00000003369 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Sfi1-210ENSMUST00000140846 3604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Nfatc1-203ENSMUST00000167977 4604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Ctnnd1-211ENSMUST00000111685 5985 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Ctnnd1-215ENSMUST00000111689 5961 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Foxp3-202ENSMUST00000115738 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Ifi213-201ENSMUST00000097462 2680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 9630001P10Rik-202ENSMUST00000181335 3006 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 A130050O07Rik-201ENSMUST00000191963 3023 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Ranbp3l-201ENSMUST00000053308 3017 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Nt5c1b-217ENSMUST00000219826 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm40893-201ENSMUST00000220507 1508 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Ap2b1-205ENSMUST00000176430 3596 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 AL589871.1-201ENSMUST00000221299 3561 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm43800-201ENSMUST00000201868 2731 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Olfr549-202ENSMUST00000217478 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm45861-201ENSMUST00000209669 7184 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 AC101875.1-201ENSMUST00000222666 2223 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Daam1-205ENSMUST00000223272 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm45718-201ENSMUST00000207577 3794 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Phactr4-201ENSMUST00000084170 4483 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm18451-201ENSMUST00000196759 1719 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Ank1-213ENSMUST00000141784 6566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Synrg-202ENSMUST00000092834 7115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Cd22-203ENSMUST00000186154 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Mtmr4-202ENSMUST00000103179 5753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Adgrf4-203ENSMUST00000167993 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Cd247-209ENSMUST00000187313 2957 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm36251-201ENSMUST00000213712 1914 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm9776-201ENSMUST00000059598 2980 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm42444-201ENSMUST00000199366 4558 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm44998-201ENSMUST00000207091 1768 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Sub1-201ENSMUST00000022816 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Eci2-213ENSMUST00000178421 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gsdmc3-201ENSMUST00000089894 1443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Zzz3-204ENSMUST00000106103 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Pikfyve-202ENSMUST00000097707 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxb4P10284 Gm6614-201ENSMUST00000111832 1953 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxb4P10284 Gm7389-201ENSMUST00000181162 2884 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxb4P10284 Acox3-202ENSMUST00000068947 3976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxb4P10284 Gm28333-201ENSMUST00000186034 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxb4P10284 Gm28704-201ENSMUST00000186589 2169 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxb4P10284 Gm29636-201ENSMUST00000188149 2169 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxb4P10284 Gm28839-201ENSMUST00000189579 2171 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxb4P10284 Gm29612-201ENSMUST00000191490 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxb4P10284 Chd8-212ENSMUST00000200169 8509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxb4P10284 Lhx6-202ENSMUST00000112961 3292 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxb4P10284 Adamtsl1-203ENSMUST00000107178 7839 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxb4P10284 Rpl35a-202ENSMUST00000115075 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxb4P10284 Hmgb1-rs18-201ENSMUST00000117940 627 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxb4P10284 Gm11903-201ENSMUST00000118958 727 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxb4P10284 Gm5060-201ENSMUST00000120072 599 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxb4P10284 Gm14186-201ENSMUST00000120804 137 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxb4P10284 Gm13356-201ENSMUST00000121678 335 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxb4P10284 Gm11507-201ENSMUST00000156462 412 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxb4P10284 Gm23903-201ENSMUST00000157566 131 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxb4P10284 Gm24343-201ENSMUST00000158708 111 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxb4P10284 Cfap54-204ENSMUST00000164979 945 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.8 ms