Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cldn6Q9Z262 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn6Q9Z262 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn6Q9Z262 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn6Q9Z262 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn6Q9Z262 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn6Q9Z262 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn6Q9Z262 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn6Q9Z262 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn6Q9Z262 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn6Q9Z262 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn6Q9Z262 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn6Q9Z262 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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