Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S5

Cldn15, Claudin-15, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn15Q9Z0S5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn15Q9Z0S5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn15Q9Z0S5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn15Q9Z0S5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn15Q9Z0S5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn15Q9Z0S5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn15Q9Z0S5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn15Q9Z0S5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms