Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms