Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUT7

Ccr9, C-C chemokine receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr9Q9WUT7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr9Q9WUT7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms