Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1I1

Chst4, Carbohydrate sulfotransferase 4, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chst4Q9R1I1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chst4Q9R1I1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chst4Q9R1I1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chst4Q9R1I1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chst4Q9R1I1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chst4Q9R1I1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chst4Q9R1I1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chst4Q9R1I1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Chst4Q9R1I1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chst4Q9R1I1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chst4Q9R1I1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chst4Q9R1I1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chst4Q9R1I1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Chst4Q9R1I1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chst4Q9R1I1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chst4Q9R1I1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chst4Q9R1I1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chst4Q9R1I1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chst4Q9R1I1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chst4Q9R1I1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chst4Q9R1I1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chst4Q9R1I1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chst4Q9R1I1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chst4Q9R1I1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Chst4Q9R1I1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chst4Q9R1I1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Chst4Q9R1I1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chst4Q9R1I1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chst4Q9R1I1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chst4Q9R1I1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chst4Q9R1I1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chst4Q9R1I1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chst4Q9R1I1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chst4Q9R1I1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chst4Q9R1I1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chst4Q9R1I1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chst4Q9R1I1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chst4Q9R1I1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chst4Q9R1I1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chst4Q9R1I1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chst4Q9R1I1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chst4Q9R1I1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chst4Q9R1I1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Chst4Q9R1I1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chst4Q9R1I1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chst4Q9R1I1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chst4Q9R1I1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chst4Q9R1I1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chst4Q9R1I1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chst4Q9R1I1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chst4Q9R1I1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Chst4Q9R1I1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chst4Q9R1I1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chst4Q9R1I1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chst4Q9R1I1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chst4Q9R1I1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Chst4Q9R1I1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Chst4Q9R1I1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chst4Q9R1I1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chst4Q9R1I1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chst4Q9R1I1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Chst4Q9R1I1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Chst4Q9R1I1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chst4Q9R1I1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chst4Q9R1I1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Chst4Q9R1I1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chst4Q9R1I1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chst4Q9R1I1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chst4Q9R1I1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Chst4Q9R1I1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chst4Q9R1I1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chst4Q9R1I1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chst4Q9R1I1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chst4Q9R1I1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chst4Q9R1I1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chst4Q9R1I1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chst4Q9R1I1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chst4Q9R1I1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chst4Q9R1I1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Chst4Q9R1I1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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