Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXU7

Prok2, Prokineticin-2, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prok2Q9QXU7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prok2Q9QXU7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prok2Q9QXU7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prok2Q9QXU7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prok2Q9QXU7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prok2Q9QXU7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prok2Q9QXU7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prok2Q9QXU7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prok2Q9QXU7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prok2Q9QXU7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prok2Q9QXU7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prok2Q9QXU7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prok2Q9QXU7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prok2Q9QXU7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prok2Q9QXU7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prok2Q9QXU7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prok2Q9QXU7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prok2Q9QXU7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prok2Q9QXU7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prok2Q9QXU7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prok2Q9QXU7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prok2Q9QXU7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prok2Q9QXU7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prok2Q9QXU7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prok2Q9QXU7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prok2Q9QXU7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prok2Q9QXU7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prok2Q9QXU7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prok2Q9QXU7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prok2Q9QXU7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prok2Q9QXU7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prok2Q9QXU7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Prok2Q9QXU7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prok2Q9QXU7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prok2Q9QXU7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prok2Q9QXU7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prok2Q9QXU7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prok2Q9QXU7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prok2Q9QXU7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prok2Q9QXU7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prok2Q9QXU7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prok2Q9QXU7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prok2Q9QXU7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prok2Q9QXU7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prok2Q9QXU7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prok2Q9QXU7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prok2Q9QXU7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prok2Q9QXU7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prok2Q9QXU7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prok2Q9QXU7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prok2Q9QXU7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prok2Q9QXU7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prok2Q9QXU7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prok2Q9QXU7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prok2Q9QXU7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prok2Q9QXU7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prok2Q9QXU7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prok2Q9QXU7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prok2Q9QXU7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prok2Q9QXU7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prok2Q9QXU7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prok2Q9QXU7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prok2Q9QXU7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prok2Q9QXU7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prok2Q9QXU7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prok2Q9QXU7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prok2Q9QXU7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prok2Q9QXU7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prok2Q9QXU7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prok2Q9QXU7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prok2Q9QXU7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prok2Q9QXU7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prok2Q9QXU7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prok2Q9QXU7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prok2Q9QXU7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prok2Q9QXU7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prok2Q9QXU7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prok2Q9QXU7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prok2Q9QXU7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prok2Q9QXU7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prok2Q9QXU7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prok2Q9QXU7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prok2Q9QXU7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prok2Q9QXU7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prok2Q9QXU7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prok2Q9QXU7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prok2Q9QXU7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prok2Q9QXU7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prok2Q9QXU7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prok2Q9QXU7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prok2Q9QXU7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prok2Q9QXU7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prok2Q9QXU7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prok2Q9QXU7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prok2Q9QXU7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prok2Q9QXU7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prok2Q9QXU7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prok2Q9QXU7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prok2Q9QXU7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prok2Q9QXU7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms