Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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