Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tspan4Q9DCK3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Tspan4Q9DCK3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan4Q9DCK3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Tspan4Q9DCK3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan4Q9DCK3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan4Q9DCK3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan4Q9DCK3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan4Q9DCK3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan4Q9DCK3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan4Q9DCK3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan4Q9DCK3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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