Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAE8

UPF0739 protein C1orf74 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DAE8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9DAE8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9DAE8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9DAE8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9DAE8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9DAE8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9DAE8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9DAE8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9DAE8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9DAE8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9DAE8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9DAE8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9DAE8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9DAE8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9DAE8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9DAE8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9DAE8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms