Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tvp23bQ9D8T4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tvp23bQ9D8T4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms