Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nop56Q9D6Z1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nop56Q9D6Z1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
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