Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms