Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

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Length 313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Snx20Q9D2Y5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx20Q9D2Y5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx20Q9D2Y5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx20Q9D2Y5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx20Q9D2Y5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx20Q9D2Y5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx20Q9D2Y5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx20Q9D2Y5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx20Q9D2Y5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx20Q9D2Y5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx20Q9D2Y5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx20Q9D2Y5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx20Q9D2Y5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx20Q9D2Y5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx20Q9D2Y5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx20Q9D2Y5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx20Q9D2Y5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx20Q9D2Y5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx20Q9D2Y5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx20Q9D2Y5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx20Q9D2Y5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx20Q9D2Y5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx20Q9D2Y5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx20Q9D2Y5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx20Q9D2Y5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx20Q9D2Y5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx20Q9D2Y5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx20Q9D2Y5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx20Q9D2Y5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx20Q9D2Y5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx20Q9D2Y5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx20Q9D2Y5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx20Q9D2Y5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx20Q9D2Y5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx20Q9D2Y5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx20Q9D2Y5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx20Q9D2Y5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx20Q9D2Y5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx20Q9D2Y5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx20Q9D2Y5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx20Q9D2Y5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx20Q9D2Y5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx20Q9D2Y5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx20Q9D2Y5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx20Q9D2Y5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx20Q9D2Y5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms