Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYQ5

Hcfc1r1, Host cell factor C1 regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcfc1r1Q9CYQ5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms