Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXV1

Sdhd, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdhdQ9CXV1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SdhdQ9CXV1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SdhdQ9CXV1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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