Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Exo5Q9CXP9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Exo5Q9CXP9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Exo5Q9CXP9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Exo5Q9CXP9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Exo5Q9CXP9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Exo5Q9CXP9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Exo5Q9CXP9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Exo5Q9CXP9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Exo5Q9CXP9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Exo5Q9CXP9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.7 ms