Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ90

Uncharacterized protein C9orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQ90 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQ90 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQ90 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CQ90 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQ90 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CQ90 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Hesx1-201ENSMUST00000035433 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CQ90 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms