Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atg3Q9CPX6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg3Q9CPX6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg3Q9CPX6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg3Q9CPX6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg3Q9CPX6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg3Q9CPX6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg3Q9CPX6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg3Q9CPX6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg3Q9CPX6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg3Q9CPX6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg3Q9CPX6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg3Q9CPX6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg3Q9CPX6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg3Q9CPX6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atg3Q9CPX6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atg3Q9CPX6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atg3Q9CPX6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atg3Q9CPX6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atg3Q9CPX6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atg3Q9CPX6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atg3Q9CPX6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atg3Q9CPX6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atg3Q9CPX6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atg3Q9CPX6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Atg3Q9CPX6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atg3Q9CPX6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atg3Q9CPX6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atg3Q9CPX6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atg3Q9CPX6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atg3Q9CPX6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atg3Q9CPX6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atg3Q9CPX6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atg3Q9CPX6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atg3Q9CPX6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atg3Q9CPX6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atg3Q9CPX6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atg3Q9CPX6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg3Q9CPX6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg3Q9CPX6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg3Q9CPX6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg3Q9CPX6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg3Q9CPX6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg3Q9CPX6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg3Q9CPX6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg3Q9CPX6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg3Q9CPX6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg3Q9CPX6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg3Q9CPX6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg3Q9CPX6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg3Q9CPX6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg3Q9CPX6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg3Q9CPX6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg3Q9CPX6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg3Q9CPX6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg3Q9CPX6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atg3Q9CPX6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atg3Q9CPX6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atg3Q9CPX6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atg3Q9CPX6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Atg3Q9CPX6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atg3Q9CPX6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atg3Q9CPX6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atg3Q9CPX6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atg3Q9CPX6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg3Q9CPX6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg3Q9CPX6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg3Q9CPX6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg3Q9CPX6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg3Q9CPX6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg3Q9CPX6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg3Q9CPX6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg3Q9CPX6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg3Q9CPX6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg3Q9CPX6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg3Q9CPX6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg3Q9CPX6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg3Q9CPX6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg3Q9CPX6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg3Q9CPX6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg3Q9CPX6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg3Q9CPX6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg3Q9CPX6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg3Q9CPX6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg3Q9CPX6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg3Q9CPX6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg3Q9CPX6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg3Q9CPX6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg3Q9CPX6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg3Q9CPX6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg3Q9CPX6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg3Q9CPX6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg3Q9CPX6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg3Q9CPX6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atg3Q9CPX6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atg3Q9CPX6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atg3Q9CPX6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atg3Q9CPX6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Atg3Q9CPX6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Atg3Q9CPX6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms