Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Nus1Q99LJ8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms