Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms