Protein–RNA interactions for Protein: Q91YJ2

Snx4, Sorting nexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx4Q91YJ2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx4Q91YJ2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx4Q91YJ2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx4Q91YJ2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx4Q91YJ2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx4Q91YJ2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx4Q91YJ2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx4Q91YJ2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx4Q91YJ2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx4Q91YJ2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx4Q91YJ2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx4Q91YJ2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx4Q91YJ2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx4Q91YJ2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx4Q91YJ2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx4Q91YJ2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx4Q91YJ2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx4Q91YJ2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx4Q91YJ2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx4Q91YJ2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx4Q91YJ2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx4Q91YJ2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms