Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Csde1Q91W50 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Csde1Q91W50 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csde1Q91W50 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csde1Q91W50 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csde1Q91W50 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csde1Q91W50 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csde1Q91W50 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csde1Q91W50 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csde1Q91W50 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csde1Q91W50 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csde1Q91W50 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csde1Q91W50 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csde1Q91W50 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Csde1Q91W50 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csde1Q91W50 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csde1Q91W50 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csde1Q91W50 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csde1Q91W50 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csde1Q91W50 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csde1Q91W50 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csde1Q91W50 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csde1Q91W50 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csde1Q91W50 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csde1Q91W50 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csde1Q91W50 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csde1Q91W50 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csde1Q91W50 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csde1Q91W50 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csde1Q91W50 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Csde1Q91W50 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Csde1Q91W50 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Csde1Q91W50 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Csde1Q91W50 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Csde1Q91W50 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Csde1Q91W50 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Csde1Q91W50 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Csde1Q91W50 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Csde1Q91W50 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Csde1Q91W50 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Csde1Q91W50 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Csde1Q91W50 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Csde1Q91W50 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Csde1Q91W50 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Csde1Q91W50 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Csde1Q91W50 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Csde1Q91W50 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Csde1Q91W50 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Csde1Q91W50 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Csde1Q91W50 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Csde1Q91W50 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Csde1Q91W50 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Csde1Q91W50 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Csde1Q91W50 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Csde1Q91W50 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Csde1Q91W50 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Csde1Q91W50 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Csde1Q91W50 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Csde1Q91W50 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Csde1Q91W50 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Csde1Q91W50 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Csde1Q91W50 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Csde1Q91W50 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Csde1Q91W50 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Csde1Q91W50 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Csde1Q91W50 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Csde1Q91W50 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Csde1Q91W50 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Csde1Q91W50 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Csde1Q91W50 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Csde1Q91W50 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Csde1Q91W50 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Csde1Q91W50 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Csde1Q91W50 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Csde1Q91W50 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Csde1Q91W50 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Csde1Q91W50 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Csde1Q91W50 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Csde1Q91W50 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Csde1Q91W50 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Csde1Q91W50 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Csde1Q91W50 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Csde1Q91W50 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Csde1Q91W50 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Csde1Q91W50 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Csde1Q91W50 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Csde1Q91W50 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Csde1Q91W50 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Csde1Q91W50 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Csde1Q91W50 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Csde1Q91W50 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Csde1Q91W50 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Csde1Q91W50 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Csde1Q91W50 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Csde1Q91W50 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Csde1Q91W50 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Csde1Q91W50 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Csde1Q91W50 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Csde1Q91W50 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Csde1Q91W50 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms