Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms