Protein–RNA interactions for Protein: Q8K203

Neil3, Endonuclease 8-like 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil3Q8K203 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Neil3Q8K203 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Neil3Q8K203 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Neil3Q8K203 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Neil3Q8K203 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Neil3Q8K203 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Neil3Q8K203 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Neil3Q8K203 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Neil3Q8K203 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Neil3Q8K203 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Neil3Q8K203 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Neil3Q8K203 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Neil3Q8K203 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Neil3Q8K203 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Neil3Q8K203 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Neil3Q8K203 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms