Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0Y2

Krt33a, Keratin, type I cuticular Ha3-I, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt33aQ8K0Y2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt33aQ8K0Y2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms