Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZR6

Slc4a8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a8Q8JZR6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Slc4a8Q8JZR6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Slc4a8Q8JZR6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Slc4a8Q8JZR6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Slc4a8Q8JZR6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Slc4a8Q8JZR6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Slc4a8Q8JZR6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc4a8Q8JZR6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc4a8Q8JZR6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc4a8Q8JZR6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc4a8Q8JZR6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc4a8Q8JZR6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc4a8Q8JZR6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc4a8Q8JZR6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc4a8Q8JZR6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc4a8Q8JZR6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc4a8Q8JZR6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc4a8Q8JZR6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc4a8Q8JZR6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc4a8Q8JZR6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc4a8Q8JZR6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc4a8Q8JZR6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc4a8Q8JZR6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms