Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CopaQ8CIE6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CopaQ8CIE6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms