Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGA3

Slc43a2, Large neutral amino acids transporter small subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc43a2Q8CGA3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms