Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Ercc8Q8CFD5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Ercc8Q8CFD5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Ercc8Q8CFD5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Ercc8Q8CFD5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
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