Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp20Q8C6M1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp20Q8C6M1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp20Q8C6M1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp20Q8C6M1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp20Q8C6M1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp20Q8C6M1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp20Q8C6M1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp20Q8C6M1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp20Q8C6M1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Usp20Q8C6M1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Usp20Q8C6M1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Usp20Q8C6M1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Usp20Q8C6M1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Usp20Q8C6M1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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