Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ssuh2Q8C3L1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssuh2Q8C3L1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssuh2Q8C3L1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssuh2Q8C3L1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssuh2Q8C3L1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssuh2Q8C3L1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssuh2Q8C3L1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssuh2Q8C3L1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssuh2Q8C3L1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssuh2Q8C3L1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssuh2Q8C3L1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssuh2Q8C3L1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssuh2Q8C3L1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssuh2Q8C3L1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssuh2Q8C3L1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssuh2Q8C3L1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssuh2Q8C3L1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssuh2Q8C3L1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssuh2Q8C3L1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssuh2Q8C3L1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssuh2Q8C3L1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssuh2Q8C3L1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssuh2Q8C3L1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms