Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV16

Zfp398, Zinc finger protein 398, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp398Q8BV16 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfp398Q8BV16 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zfp398Q8BV16 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zfp398Q8BV16 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zfp398Q8BV16 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zfp398Q8BV16 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zfp398Q8BV16 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zfp398Q8BV16 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp398Q8BV16 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp398Q8BV16 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp398Q8BV16 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp398Q8BV16 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms