Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTQ0

PcgF3, Polycomb group RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcgF3Q8BTQ0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms