Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms