Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM3

Trim17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim17Q7TPM3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trim17Q7TPM3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trim17Q7TPM3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trim17Q7TPM3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trim17Q7TPM3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trim17Q7TPM3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trim17Q7TPM3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Trim17Q7TPM3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trim17Q7TPM3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trim17Q7TPM3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trim17Q7TPM3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trim17Q7TPM3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Trim17Q7TPM3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trim17Q7TPM3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trim17Q7TPM3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trim17Q7TPM3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trim17Q7TPM3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trim17Q7TPM3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Trim17Q7TPM3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Trim17Q7TPM3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Trim17Q7TPM3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim17Q7TPM3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms