Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tpm4Q6IRU2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tpm4Q6IRU2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tpm4Q6IRU2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tpm4Q6IRU2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tpm4Q6IRU2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tpm4Q6IRU2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tpm4Q6IRU2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tpm4Q6IRU2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tpm4Q6IRU2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tpm4Q6IRU2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tpm4Q6IRU2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tpm4Q6IRU2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tpm4Q6IRU2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tpm4Q6IRU2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tpm4Q6IRU2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tpm4Q6IRU2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tpm4Q6IRU2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tpm4Q6IRU2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tpm4Q6IRU2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tpm4Q6IRU2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tpm4Q6IRU2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tpm4Q6IRU2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tpm4Q6IRU2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tpm4Q6IRU2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tpm4Q6IRU2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tpm4Q6IRU2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tpm4Q6IRU2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tpm4Q6IRU2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tpm4Q6IRU2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tpm4Q6IRU2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tpm4Q6IRU2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tpm4Q6IRU2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tpm4Q6IRU2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tpm4Q6IRU2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tpm4Q6IRU2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tpm4Q6IRU2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tpm4Q6IRU2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tpm4Q6IRU2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tpm4Q6IRU2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tpm4Q6IRU2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tpm4Q6IRU2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tpm4Q6IRU2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tpm4Q6IRU2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tpm4Q6IRU2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tpm4Q6IRU2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tpm4Q6IRU2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tpm4Q6IRU2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tpm4Q6IRU2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tpm4Q6IRU2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tpm4Q6IRU2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tpm4Q6IRU2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tpm4Q6IRU2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tpm4Q6IRU2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tpm4Q6IRU2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tpm4Q6IRU2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tpm4Q6IRU2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tpm4Q6IRU2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tpm4Q6IRU2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tpm4Q6IRU2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tpm4Q6IRU2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tpm4Q6IRU2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tpm4Q6IRU2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tpm4Q6IRU2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tpm4Q6IRU2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tpm4Q6IRU2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tpm4Q6IRU2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tpm4Q6IRU2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tpm4Q6IRU2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpm4Q6IRU2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpm4Q6IRU2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpm4Q6IRU2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpm4Q6IRU2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpm4Q6IRU2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpm4Q6IRU2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpm4Q6IRU2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpm4Q6IRU2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpm4Q6IRU2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpm4Q6IRU2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpm4Q6IRU2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpm4Q6IRU2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpm4Q6IRU2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpm4Q6IRU2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpm4Q6IRU2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpm4Q6IRU2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpm4Q6IRU2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpm4Q6IRU2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpm4Q6IRU2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpm4Q6IRU2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpm4Q6IRU2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpm4Q6IRU2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpm4Q6IRU2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpm4Q6IRU2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpm4Q6IRU2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpm4Q6IRU2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpm4Q6IRU2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpm4Q6IRU2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpm4Q6IRU2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tpm4Q6IRU2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tpm4Q6IRU2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms