Protein–RNA interactions for Protein: Q63955

Pou4f3, POU domain, class 4, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f3Q63955 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms