Protein–RNA interactions for Protein: Q62249

Sox19, Protein SOX-19 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox19Q62249 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms