Protein–RNA interactions for Protein: Q62035

Ptafr, Platelet-activating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtafrQ62035 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PtafrQ62035 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PtafrQ62035 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PtafrQ62035 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtafrQ62035 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtafrQ62035 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtafrQ62035 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtafrQ62035 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtafrQ62035 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtafrQ62035 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtafrQ62035 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtafrQ62035 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PtafrQ62035 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtafrQ62035 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtafrQ62035 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PtafrQ62035 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PtafrQ62035 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtafrQ62035 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtafrQ62035 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PtafrQ62035 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtafrQ62035 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtafrQ62035 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtafrQ62035 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PtafrQ62035 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtafrQ62035 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtafrQ62035 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtafrQ62035 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtafrQ62035 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtafrQ62035 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtafrQ62035 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtafrQ62035 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtafrQ62035 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtafrQ62035 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtafrQ62035 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtafrQ62035 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtafrQ62035 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms