Protein–RNA interactions for Protein: Q61897

Krt33b, Keratin, type I cuticular Ha3-II, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt33bQ61897 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt33bQ61897 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt33bQ61897 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt33bQ61897 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt33bQ61897 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt33bQ61897 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt33bQ61897 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt33bQ61897 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt33bQ61897 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt33bQ61897 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt33bQ61897 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt33bQ61897 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt33bQ61897 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt33bQ61897 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt33bQ61897 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt33bQ61897 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt33bQ61897 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt33bQ61897 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt33bQ61897 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt33bQ61897 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt33bQ61897 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt33bQ61897 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt33bQ61897 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt33bQ61897 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt33bQ61897 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt33bQ61897 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt33bQ61897 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt33bQ61897 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt33bQ61897 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt33bQ61897 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt33bQ61897 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt33bQ61897 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt33bQ61897 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt33bQ61897 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt33bQ61897 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt33bQ61897 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt33bQ61897 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt33bQ61897 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt33bQ61897 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt33bQ61897 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt33bQ61897 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt33bQ61897 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt33bQ61897 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt33bQ61897 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt33bQ61897 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt33bQ61897 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt33bQ61897 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt33bQ61897 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt33bQ61897 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt33bQ61897 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt33bQ61897 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt33bQ61897 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt33bQ61897 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt33bQ61897 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt33bQ61897 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt33bQ61897 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt33bQ61897 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt33bQ61897 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms