Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BcanQ61361 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BcanQ61361 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BcanQ61361 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BcanQ61361 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BcanQ61361 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BcanQ61361 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BcanQ61361 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BcanQ61361 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BcanQ61361 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BcanQ61361 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BcanQ61361 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BcanQ61361 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BcanQ61361 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BcanQ61361 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
BcanQ61361 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
BcanQ61361 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BcanQ61361 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BcanQ61361 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BcanQ61361 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BcanQ61361 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
BcanQ61361 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BcanQ61361 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BcanQ61361 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BcanQ61361 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BcanQ61361 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BcanQ61361 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BcanQ61361 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BcanQ61361 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BcanQ61361 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BcanQ61361 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BcanQ61361 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BcanQ61361 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BcanQ61361 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BcanQ61361 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BcanQ61361 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BcanQ61361 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BcanQ61361 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BcanQ61361 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BcanQ61361 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BcanQ61361 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BcanQ61361 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BcanQ61361 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BcanQ61361 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BcanQ61361 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BcanQ61361 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BcanQ61361 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BcanQ61361 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BcanQ61361 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BcanQ61361 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BcanQ61361 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BcanQ61361 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BcanQ61361 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BcanQ61361 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BcanQ61361 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BcanQ61361 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BcanQ61361 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BcanQ61361 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BcanQ61361 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BcanQ61361 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BcanQ61361 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
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