Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Stxbp3Q60770 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Stxbp3Q60770 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Stxbp3Q60770 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Stxbp3Q60770 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Stxbp3Q60770 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Stxbp3Q60770 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Stxbp3Q60770 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Stxbp3Q60770 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stxbp3Q60770 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stxbp3Q60770 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stxbp3Q60770 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stxbp3Q60770 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stxbp3Q60770 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stxbp3Q60770 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stxbp3Q60770 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stxbp3Q60770 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stxbp3Q60770 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stxbp3Q60770 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stxbp3Q60770 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stxbp3Q60770 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Stxbp3Q60770 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stxbp3Q60770 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stxbp3Q60770 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stxbp3Q60770 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stxbp3Q60770 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stxbp3Q60770 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stxbp3Q60770 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stxbp3Q60770 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stxbp3Q60770 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Stxbp3Q60770 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stxbp3Q60770 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stxbp3Q60770 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stxbp3Q60770 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stxbp3Q60770 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stxbp3Q60770 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stxbp3Q60770 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stxbp3Q60770 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stxbp3Q60770 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stxbp3Q60770 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stxbp3Q60770 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stxbp3Q60770 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stxbp3Q60770 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stxbp3Q60770 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stxbp3Q60770 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stxbp3Q60770 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Stxbp3Q60770 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stxbp3Q60770 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stxbp3Q60770 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stxbp3Q60770 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stxbp3Q60770 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stxbp3Q60770 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Stxbp3Q60770 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stxbp3Q60770 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Stxbp3Q60770 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Stxbp3Q60770 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Stxbp3Q60770 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Stxbp3Q60770 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Stxbp3Q60770 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Stxbp3Q60770 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Stxbp3Q60770 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Stxbp3Q60770 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Stxbp3Q60770 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Stxbp3Q60770 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Stxbp3Q60770 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Stxbp3Q60770 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Stxbp3Q60770 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Stxbp3Q60770 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Stxbp3Q60770 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Stxbp3Q60770 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Stxbp3Q60770 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Stxbp3Q60770 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Stxbp3Q60770 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Stxbp3Q60770 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Stxbp3Q60770 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Stxbp3Q60770 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Stxbp3Q60770 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Stxbp3Q60770 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Stxbp3Q60770 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Stxbp3Q60770 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Stxbp3Q60770 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Stxbp3Q60770 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Stxbp3Q60770 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Stxbp3Q60770 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Stxbp3Q60770 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Stxbp3Q60770 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Stxbp3Q60770 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Stxbp3Q60770 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Stxbp3Q60770 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Stxbp3Q60770 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Stxbp3Q60770 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Stxbp3Q60770 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Stxbp3Q60770 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Stxbp3Q60770 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Stxbp3Q60770 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Stxbp3Q60770 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Stxbp3Q60770 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Stxbp3Q60770 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Stxbp3Q60770 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Stxbp3Q60770 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms