Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Fam220aQ3ZN08 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Fam220aQ3ZN08 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Fam220aQ3ZN08 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Fam220aQ3ZN08 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam220aQ3ZN08 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Fam220aQ3ZN08 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam220aQ3ZN08 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam220aQ3ZN08 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Fam220aQ3ZN08 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam220aQ3ZN08 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam220aQ3ZN08 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam220aQ3ZN08 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam220aQ3ZN08 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Fam220aQ3ZN08 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Fam220aQ3ZN08 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam220aQ3ZN08 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam220aQ3ZN08 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam220aQ3ZN08 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam220aQ3ZN08 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam220aQ3ZN08 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam220aQ3ZN08 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam220aQ3ZN08 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam220aQ3ZN08 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam220aQ3ZN08 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam220aQ3ZN08 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam220aQ3ZN08 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam220aQ3ZN08 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam220aQ3ZN08 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam220aQ3ZN08 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam220aQ3ZN08 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam220aQ3ZN08 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam220aQ3ZN08 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam220aQ3ZN08 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam220aQ3ZN08 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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