Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E330034G19RikQ3UWX6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms