Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQS0

Calr4, Calreticulin 4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr4Q3TQS0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Calr4Q3TQS0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms